Helsingfors grundades år 1550 av Gustav Vasa. Det var på grund av att han ville ta upp den ekonomiska kampen med Reval (nuvarande Tallinn) på andra sidan Finska viken. Det gick inte riktigt som han hade tänkt sig och den tvångskommenderade befolkningen fick senare flytta tillbaka till sina hemorter.
1703 blev Helsingfors ockuperat utav Ryssland, och innan det härjade pesten i staden.
Under andra världskriget bombarderades Helsingfors kontinuerligt. Förutom London och Moskva var det den enda huvudstaden i de krigförande länderna som aldrig blev erövrat under kriget.
1900-talets första hälft var alltså en väldigt våldsam tid för Helsingfors men trots det fortsatte staden att utvecklas. Den 6 december 1917 blev Finland självständighetsförklarat.
OS hölls på Olympiastadion i Helsingfors år 1952. Metron (Helsingfors tunnelbana) öppnades 1975. Helsingfors var en av de snabbast växande tätorterna i EU under 1990-talet och vid millennieskiftet 2000 hade Helsingfors blivit en av Europas kulturhuvudstäder.